由于空氣中缺乏營養物質，干燥，流動以及陽光的直接照射，進入空氣中的微生物很快就會死亡。只有一些對干燥和陽光抵抗力強，能產生芽孢或色素的細菌及真菌的孢子能存在于空氣中。空氣不是微生物生長繁殖的適宜自然環境。空氣中微生物的主要來源是地面上的微生物伴隨著土壤塵埃、水滴、動物哞叫、噴嚏、咳嗽時噴出的飛沫等微粒一并飛揚進入；霉菌的孢子，則常被氣流直接吹散入空氣中。它們的存在給乳品工業、食品工業、發酵工業等生產可能帶來經濟上的損失，也常是微生物實驗室、生物制品的污染和外科手術創口感染的來源之一。
　　目前空氣中存在較多的、存活時間較長是各種真菌、放線菌的孢子及細菌芽胞。 空氣中微生物絕大多數是非致病的腐生菌，常見的有微球菌屬、芽孢桿菌屬、棒狀桿菌屬、八疊球菌屬、芽枝毒屬、交鏈孢霉屬、青霉屬、曲霉屬等。
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